在线研讨会:11月1日-使用Oxford Nanopore平台开展肿瘤及配对样本的基因组和表观遗传学研究

发表时间:2023-10-28 15:10

基因组不稳定是大多数癌症的特征。对肿瘤-正常组织进行全基因组测序,能够深入了解癌症中的基因组和表观基因组变异性,这有助于发现新的癌症生物标志物,并进一步了解对治疗耐受的肿瘤的遗传学信息。


传统测序技术必须对短 DNA 片段进行聚合酶链式反应 (PCR) 处理,这会清除所有表观遗传信息、引入偏倚,而且只能对扩增区域进行变异检测。此外,长达 Mb 级的复杂结构变异 (SV) 无法被短读长覆盖,可能会被遗漏。


Oxford Nanopore纳米孔长读长测序技术能在单次测序分析中捕获广泛类型的肿瘤特异性变异,即有可能获得更准确的肿瘤分类,并识别参与癌症进程的驱动突变,从而为癌症研究样本的分子表征提供更深的解析度。


欢迎您加入我们11月1日的线上分享会,深入了解癌症研究中的基因组和表观遗传学应用。Oxford Nanopore 的现场应用专家严舒琪将与您分享:


  • 如何分析癌症研究样本中肿瘤 - 正常组织(tumour-nomal)纳米孔测序数据的基因组和表观基因组变异

  • 如何使用 EPI2ME 的 wf-somatic-variation 数据分析流程来检测 SV、甲基化和 SNV。


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嘉宾简介


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演讲嘉宾:严舒琪 Oxford Nanopore Technologies,现场应用专家


个人简介:严舒琪本科毕业于武汉大学生命科学学院,研究生毕业于美国纽约州立大学石溪分校。她在基因组学领域有超过15年的工作经验,曾在中美多家国际知名企业担任研发科学家和产品经理。现在是Oxford Nanopore Technologies的现场应用专家。


演讲主题:使用Oxford Nanopore平台开展肿瘤及配对样本的基因组和表观遗传学研究


演讲摘要:本次线上研讨会,我们将介绍如何利用Oxford Nanopore测序技术分析来自肿瘤研究样本中的基因组和表观遗传学变异。详细内容包括:


Oxford Nanopore长读长测序能够对原始DNA进行测序,这可以用于准确识别结构变异(SVs)、甲基化修饰、单核苷酸变异(SNV)和拷贝数变异(CNV), 并进行单倍型分析。


同时,我们还将介绍如何使用Oxford Nanopore 的EPI2ME 生信分析流程wf-somatic-variation分析肿瘤和对照样本中的SVs、甲基化和SNVs等变异,并解释分析流程的基本功能和高级功能。



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