ONT席飞虎博士丨使用纳米孔测序检测甲基化:Remora算法和RRMS流程

发表时间:2022-08-29 14:05

表观遗传学是一种不涉及核苷酸序列改变的遗传性表型变化的研究,在基因表达中起着关键作用,并与包括癌症在内的许多疾病相关。由于 PCR 的扩增过程会消除碱基修饰信息,通过传统测序技术对其进行检测需要使用特殊的文库制备步骤,从而造成核酸损坏,最终导致测序读长序列非常短。


使用纳米孔测序时,无需进行 PCR 扩增,可保留并直接检测 DNA 和 RNA 修饰,包括 DNA 中的 5mC、5hmC、6mA 和 BrdU,以及 RNA 中的 m6A,并通过训练碱基识别算法检测其他天然或合成的表观遗传修饰,无需额外的文库制备步骤,可在单个数据集中鉴定长程表观遗传变化、结构变异和单核苷酸多态性,有着显著的优势。


8月31日下午14:00-15:00,我们邀请到Oxford Nanopore Technologies领域应用技术专家席飞虎博士做“使用纳米孔测序检测甲基化:Remora算法和RRMS流程”主题报告,分享纳米孔测序在甲基化检测中的应用及优势,并对Remora算法和RRMS流程进行介绍。



日程安排

14:00 - 14:05

开场介绍

14:05 – 14:45

使用纳米孔测序检测甲基化:Remora算法和RRMS流程

  • 纳米孔测序原理以及如何识别甲基化

  • Remora: 识别5mC CpGs的全新“金标准”

  • RRMS: 利用Adaptive sampling靶向检测甲基化

·14:45 – 15:00

问答环节

报名方式

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嘉宾简介

席飞虎博士

Oxford Nanopore Technologies

领域应用技术专家


席飞虎博士在使用纳米孔测序进行 gDNA 和直接 RNA 测序方面拥有超过 4 年实操经验。在加入 Oxford Nanopore之前,他在研究团队中建立并领导了 ONT 测序平台,用于 DNA 甲基化和 RNA 碱基修饰检测的生物信息学研究。




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