《Nature Genetics》：跨种族GWAS检测到新的肺癌易感基因位点

早筛网讯：近日，由贝勒医学院的研究人员领导的一个国际团队利用全基因组关联研究（GWAS）跨种族荟萃分析识别到了新的肺癌易感位点。

该研究在8月1日以“Cross-ancestry genome-wide meta-analysis of 61,047 cases and 947,237 controls identifies new susceptibility loci contributing to lung cancer”为题发表在《Nature Genetics》上。

“了解肺癌遗传易感性将有助于揭示肺癌的进展机制和确定新的易感性标志物，以便针对早期检测和诊断、靶向治疗和预防措施改进进行更好的风险评估。”资深和通讯作者、BCM临床和转化医学研究所主任Christopher Amos及其同事解释说。

“大多数GWAS都专注于欧洲血统人群的遗传同质病例对照研究。”Christopher表示，“如果低频和罕见等位基因在一个人群中更常见，那么跨种族分析可以改善关联信号的检测，并且当不同人群的功能变体和标记等位基因之间的连锁不平衡 (LD) 存在变异性时，能够有助于查明功能变体。”

除了过去的研究中涉及的肺癌风险有关的变体外，该团队还强调了在已知的位点上几个以前没有发现的变体关联，以及过去没有报告过的五个位点。这些易感位点包括某些人群或肺癌组织学亚型所特有的肺癌易感位点，如肺腺癌、肺鳞状细胞癌或小细胞肺癌。

虽然肺癌风险通常与祖先群体中的15个风险基因座一致，但研究人员将14个新的和已知的风险基因座与腺癌联系了起来，他们还检测到九个鳞状细胞癌相关位点和两个与小细胞肺癌相关的位点。

他们的分析还指出了罕见的和更常见的风险变体，这些变体似乎对肺癌风险有人群特异性的影响，包括一个罕见的IL17RC变体，其与欧洲或非洲血统个体的小细胞癌有关联，以及一个低频的HCG15基因变体，其与非洲血统参与者的小细胞肺癌有关联。

“罕见变异的关联往往会在特定人群中出现，”Christopher报告说，“即使是影响吸烟行为的常见变异关联，也显示出人群特异性。”

在此基础上，研究人员转向精细映射和表达定量性状位点分析，结合DNA损伤检测，研究人员重点关注几个与肺癌相关的组织和48个候选基因，这些基因似乎可以解释检测到的一些新的和已知的肺癌风险关联--这个集合包括来自与DNA损伤、细胞应激反应或免疫活动相关的潜在可瞄准途径的风险基因。

Christopher表示：“总的来说，对多种族人群进行跨种族GWAS的荟萃分析将有助于阐明肺癌的病因和机制。”